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关于举办“蛋白质结构解析与智能设计专题（线上）培训班”的通知
各有关单位：
蛋白质通常被称为生命的基石，它们几乎参与了细胞内的每一个过程，包括生长、分裂和修复。蛋白质是生命活动的体现者，其结构决定着功能。由线性氨基酸组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学功能。解析蛋白质的空间结构可以更准确地认识蛋白质的功能、功能的执行、及生物大分子间的相互作用。然而，随着人工智能及大数据的快速发展，蛋白质可以通过人工智能设计从而解锁更多的功能，这在食品学、医学和药学的发展(如多肽、酶、药物靶点的设计等）具有重要意义。因此，为了进一步挖掘蛋白质新功能与充分发挥人工智能在医药及生物领域的快速发展，协会决定于2024年1月13-14日在线上（小鹅通平台）举办“蛋白质结构解析与智能设计专题培训班。”届时将邀请行业内知名专家针对相关内容进行讲解与探讨。参会名额有限，望各有关单位积极转发或组织相关人员尽快报名参加。现将有关事项通知如下：
一、会议安排：
直播平台：小鹅通在线直播平台
1月12日：下午15：00-15：30平台网络及设备测试
1月13日-14日：上午9：00-12：00，下午14：00-17：00培训课程
（详情参考附件一）
二、培训形式
1、理论讲解，实例分析，专题讲授，互动答疑
2、完成全部培训课程者由协会颁发培训证书
三、组织机构
主办单位：中国化工企业管理协会医药化工专业委员会
承办单位：中科凯晟化工技术研究院
四、培训课程及专家情况（详情参考附件一）
五、培训对象
1.蛋白质工程领域科研单位专家及学者；
2.医学、药学及食品学院校及企业蛋白质功能开发负责人；
3.生物工程领域从业工作者。
六、会议费用
4000元/单位，可投屏全员观看（含5个直播链接、2本资料、1个月有效期回放）
七、问题及报告征集（截止到1月9日）：
请在回执表问题征集栏填写您所关注及遇到的问题，以便讲师在备课时更具备针对性。
八、联系方式：
电 话：13240487419 微 信：13240487419
联 系 人: 马超 电子邮箱：1683101345@qq.com
附件一：会议课程安排表
附件二：参会报名表
中国化工企业管理协会医药化工专业委员会
中科凯晟化工技术研究院
二○二三年十一月
附件一：
蛋白质结构解析与智能设计专题培训班课程表
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1月12日下午15：00-15：30线上测试
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（第一天）1月13日
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上午
09：00
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12：00
下午
14：00
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17：00
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《蛋白质结构预测与解析》
1. 蛋白质结构预测
蛋白质理化性质和一级结构分析
分析蛋白质的 pI、Mw、氨基酸组成、消光系数、稳定系数等
分析蛋白质的亲水性和疏水性
分析蛋白质的跨膜区
信号肽预测 SignalP
蛋白质二级结构预测
蛋白质结构域预测
2. 蛋白质表达纯化
从基因克隆到蛋白表达
不同表达体系的质粒构建及优化
蛋白及复合物的表达及优化策略
蛋白质纯化及表征
蛋白质的纯化方案
蛋白复合物的制备和纯化
天然蛋白的制备和纯化
蛋白质的鉴定和理化性质分析
高难度蛋白质样品制备的思路和方法
3. 蛋白质结晶条件筛选和优化
蛋白晶体结构的特征
晶体的晶胞、晶系、空间群
蛋白晶体生长的理论知识
蛋白晶体生长条件初筛
蛋白晶体生长条件优化
4. 晶体衍射数据收集与处理(XDS, HKL, Aimless)
X射线衍射
X射线衍射的原理
X射线衍射的电子密度
晶体结构解析的相角问题
上海光源线站BL18U1、BL19U1和BL02U1收集数据的方法
5. 相位解析和优化(phenix,CCP4)
蛋白晶体结构解析软件的安装（包括Ubuntu系统、Phenix软件、CCP4软件、
PyMoL软件、XDS软件和Adxv软件）
晶体结构解析流程
Index、Intergrate和Scale
分子置换技术
蛋白晶体结构的重建
蛋白晶体结构的优化
晶体结构质量的评价指标
蛋白质结构中加入小分子配体
在结构解析过程中，如何利用软件提高分辨率
6. PDB数据提交
傅老师，毕业于美国东北大学。曾就职于默克集团，上海维亚生物公司。现于青云瑞晶负责x-ray晶体学结构解析工作，有丰富的蛋白质结构解析经验。
陈老师，博士，苏州青云瑞晶生物科技有限公司，结构生物学负责人。毕业于中国科学院生物物理研究所结构生物学专业，师从叶克穷教授从事RNA蛋白质复合物的结构生物学研究。从2009年开始蛋白质RNA复合物的结构生物学研究，有10年以上的蛋白质表达纯化及结构解析经验。在Elife、Nature Communication、Angewandte、Nucleic Acids Research等杂志发表多篇文章。在北京大学深圳研究生院、北京生命科学研究所和北京大学化学与分子工程学院均进行过研究工作。在北京大学化学与分子工程学院博士后工作期间，解析了重要疾病靶点和小分子的结构，积累了丰富经验。
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（第二天）1月14日
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上午
09：00
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12：00
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《蛋白质工程和定向进化》
1定向分子进化的概念和原理
蛋白质工程策略
适应与突变
中性理论
定向进化要点
关键里程碑
2突变库构建
体外
随机突变：epPCR
半理性/定点：Saturation mutagenesis
基于重组：DNA shuffling、StEP、ITCHY
插入缺失：RAISE、TRINS、Mini-Mu、TRIAD
体内
基于增变：OrthoRep、TADR
基于重组：MAGE、TEMR
基于CRISPR：Evolve R、CBE/ABE、BARBEKO
合成
3高通量筛选
基于光学：平板显色筛选、微孔板荧光筛选、FACS、FADS
基于互补：遗传/生长互补、化学/报告基因互补
基于区隔化： CSR、CPR
基于表面展示：Phage Display、Yeast Display、mRNA Display、Ribosome Display、cDNA Display、CIS Display、Mammalian cell Display、cell-free Display
高通量质谱
SELEX
4连续进化
PACE、OrthoRep、EvolvR、TADR
5应用场景
蛋白稳定性筛选
蛋白功能筛选
小分子结合蛋白（酶）
配体结合蛋白（抗体）
陈老师，博士，教授。2007年毕业于中国科学技术大学生物化学与分子生物学系，获理学博士学位。2007至2011年先后在美国Mayo Clinic和南加州大学进行博士后研究，开展G蛋白偶联受体的结构和功能、锌指蛋白的设计与筛选研究工作。2011年入职中国科学技术大学，聚焦蛋白质设计改造及在合成生物学中的应用。获教育部“青年长江学者”、安徽省杰青、中科院青年创新促进会等人才项目资助。研究工作发表于Nature、Nature Computational Science、Nature Communications、Nucleic Acids Research等期刊。
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下午
14：00
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17：00
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《蛋白质序列和结构升级》
1.蛋白质化学组成与稳定蛋白质结构的分子相互作用
2 分子力场、统计能量与深度学习简介
3 基于能量函数的蛋白质设计技术
4.基于人工智能的蛋白质设计技术
5.功能蛋白质设计展望
刘老师，中国科学技术大学讲席教授。国家基金委杰出青年基金获得者、创新群体项目负责人。1985-1996年在中国科学技术大学生物系学习并先后获学士和博士学位。曾在苏黎世高等理工学院研究生联合培养以及在Duke大学和UNC Chapel Hill从事博士后研究等。2001年起任中国科学技术大学生命科学学院教授。主要研究方向为蛋白质设计和基于计算的蛋白质结构功能研究。在包括Nature及子刊、PNAS、JACS、PRL等杂志发表论文百余篇。
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附件二：
蛋白质结构解析与智能设计专题培训班报名表
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发 票 抬 头
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纳税人识别号
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注 册 地 址
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注 册 电 话
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开 户 行 名 称
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专票必填
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开 户 行 账 号
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专票必填
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开 票 项 目
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培训费□ 会务费□ 专 票□ 普 票□
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必填
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参
会 代 表 登
记
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姓 名
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性 别
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职务/称
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手 机
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电 子 邮 箱
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是否需要证书：需要□ 不需要□
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会议指定收款账户：
户 名：北京邦凯企业管理咨询有限公司
开户行：中国工商银行北京玉泉路支行
账 号：020 006 300 920 005 0454
汇款请注明：线上蛋白质设计培训会务费
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1、请您准确填写上表各项信息,以
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