关于举办“2024蛋白表达、表征与结构解析专题培训班”的通知

各有关单位：

结构生物学作为生命科学领域中最为前沿的主流学科之一，是人类在最高分辨率尺度上对于生命系统认知最为直观、最为基本的学科。结构生物学研究可以提供生物大分子在原子分辨率水平的原子坐标、相互作用的细节信息以及生物大分子在行使其功能时的动态变化，这些结构信息与功能研究相结合，不仅能促进人们对生物大分子的生物功能和分子机理的认识，阐述重要的生物学问题，同时也能探索与生物大分子功能失调相关疾病的发病机理。结构相关工作共获诺贝尔奖25项，占诺贝尔奖自然科学部分的8%。在医药研发中，结构生物学也被广泛用于基于结构的新药设计。

目前蛋白质三维结构的测定主要有三大手段：X射线晶体学、核磁共振技术（NMR）以及冷冻电镜三维重构技术。核磁共振主要针对溶液中的、分子量很小（约20kDa）的样品类型，最近几年已使用不多。近年来，也出现了一些新技术，微晶电子衍射（MicroED）是一种利用冷冻电镜解析微小晶体结构的技术，由于电子束与物质的作用远强于X射线，可以解析X射线晶体学难以处理的纳米晶体结构。

蛋白质结构解析的实验过程极为复杂，涉及到多项实验操作，实验的设计中也需应用到大量结构生物学的知识，针对不同的蛋白制定不同的实验方案。为此，我单位联合苏州青云瑞晶生物科技有限公司将于2024年5月在苏州举办此次培训，从结构生物学的现状及方法等方面全面讲授相关理论知识、基本原理，更注重具体的实验操作流程及案例分析。本次培训是为广大科研工作者提供的一个系统全面地学习蛋白质结构解析的良好机会，诚邀您的参加！

一、会议安排

会议地点：苏州市（具体地址通知给已报名人员）

会议时间：2024年5月10日-12日（10日全天报到）

主办单位：中国化工企业管理协会医药化工专业委员会

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协办单位：苏州青云瑞晶生物科技有限公司

二、会议主要研讨内容及主讲老师

（一）蛋白质结晶前准备 （普通蛋白和膜蛋白）

课程介绍和蛋白质结构功能基本介绍

提纯蛋白质,确定浓度、pH值、缓冲液等条件,控制蛋白质稳定性等。

1、目的蛋白质信息检索与调查

2、质粒制备

3、蛋白质纯化

4、蛋白质不表达和包涵体问题

5、蛋白质活性鉴定

6、蛋白质结晶前分析

（二）蛋白质结晶与衍射数据收集 

利用协同结晶筛选获得蛋白质结晶,在同步辐射光源下收集衍射数据。

1、蛋白质结晶

2、SSRF（同步辐射光源） 的介绍

3、蛋白质晶体衍射数据收集

（三）蛋白质结构解析

1、晶体结构学知识

2、蛋白质晶体结构解析流程

3、Index和integrate

4、Scale

5、使用XSCALE功能进行scale

6、使用HKL2000进行index、integrate和scale

7、分子置换

8、蛋白质晶体结构构建

9、蛋白质晶体结构优化

10、蛋白质晶体结构验证

11、蛋白质晶体结构提交到PDB

12、复合物晶体结构解析

13、生物大分子结构解析疑难杂症浅谈

（四）蛋白质的鉴定和理化性质分析  

（五）结构解析软件安装、使用及展示 

1、Linux系统安装

2、蛋白质晶体结构解析软件安装。

3、pdb格式文件简介

4、PyMOL制作蛋白质晶体结构图

5、使用PyMOL制作蛋白质配体结合位点信息

6、使用PyMOL调查蛋白质的温度因子B-factors

7、使用PyMOL重叠对比不同的蛋白质晶体结构

8、使用PyMOL显示蛋白质晶体结构中配体的电子密度图

9、使用PyMOL结合Chimera实现同步显示非对称单元的蛋白质分子

（六）冷冻电镜

1、电子显微镜的基本概念

2、冷冻电子显微镜（Cryo-EM）的工作流程和细节

3、标本制备：负染和冷冻制样

4、电子显微镜的操作和图像采集方法

5、图像分析与三维重建的基本原理

6、使用cryoSPARC进行图像处理

7、断层图平均的工作流程

（七）应用案例   

1、蛋白结构在药物发现中的应用

2、蛋白结构在科研中的应用             

授课专家：

范教授毕业于中国科学院生物物理研究所，师从著名结构生物学家王院士，具有美国耶鲁大学留学六年多的背景，为独立PI。研究方向是结构生物学和免疫学；除了深钻结构生物学和免疫学，还在积极参与和推动结构生物学的教育工作，应邀在多所高校或者科研研究所开展结构生物学课程讲授, 并独立创办微信公众号“结构生物学探索“并发表将近300篇原创文章，且取得多项论文成果：在多种国际期刊上发表论文30余篇，均为SCI，作为第一作者或通讯作者4篇一区，包括国际顶尖杂志PNAS两篇，一区top2篇等。并承担国家自然科学基金面上项目等；作为国际著名学术杂志Nature Communication和Journal of Virology, Structure等的审稿人。

陈荣昌，博士，苏州青云瑞晶生物科技有限公司，结构生物学负责人。毕业于中国科学院生物物理研究所结构生物学专业，师从叶克穷教授从事RNA蛋白质复合物的结构生物学研究。从2009年开始蛋白质RNA复合物的结构生物学研究，有10年以上的蛋白质表达纯化及结构解析经验。在Elife、Nature Communication、Angewandte、Nucleic Acids Research等杂志发表多篇文章。在北京大学深圳研究生院、北京 生命科学研究所和北京大学化学与分子工程学院均进行过研究工作。在北京大学化学与分子工程学院博士后工作期间，解析了重要疾病靶点和小分子的结构，积累了丰富经验。

傅蓝德，毕业于美国东北大学。曾就职于默克集团，上海维亚生物公司。现于青云瑞晶负责x-ray晶体学结构解析工作，有丰富的蛋白质结构解析经验。

李新美。2021年博士毕业于中国科学院生物物理研究所，并于同年加入苏州青云瑞晶生物科技有限公司，任公司MicroED科学家一职。于2018年发表了国际上第一篇FIB与MicroED相结合的方法学文章，其他领域的相关结果发表在国际顶尖期刊《Science》、《cell research》、《mBio》上。2021年由苏州国际精英创业周引进的创新人才，2022年度常熟市创新创业领军人才（创新），2022年度苏州姑苏重产紧缺人才，2023年江苏省科技计划专项资金（基础研究计划自然科学基金）。发明专利1项，实用新型专利3项。

刘国强 博士 北京大学生药学专业硕士，博士进修于香港中文大学分析化学专业。曾先后就职于跨国仪器设备厂商安捷伦和赛默飞公司从事应用工程师工作，及国内大型CRO企业从事大分子实验室负责人的工作。擅长药物的结构表征、理化及生化分析，具有10余年大小分子的分析方法开发和质量研究工作经验。现任职于深圳近邻生物科技有限公司，任分析开发总监一职。

（待定）孙乐 京天成 北京市千人、北京师范大学兼职教授，中国生物技术创新服务联盟执委，SCI杂志CytoTechnology副主编。1989年毕业于清华大学生物科学与技术系，获博士学位，之后在美国奥瑞岗州立大学完成博士后研究。曾在世界最大的生物试剂公司Upstate/Merck历任生产经理和科研总监，2000年在美国创办A&G药业，其所创造的28天制备小鼠单抗的纪录至今无人能破。2004年归国创办了回而生医药科技，为Antibody Drug Conjugate领域的先驱者。2006年创建京天成，已成为世界上最强的抗体研制服务商之一，承担十多项国家和北京市重大项目及一般项目，建立起国内外最大的突发和重大传染病抗体库，在我国突发传染病应急平台建设中起到了极其重要的作用。2012年创办天成新脉，建立起专利保护的抗体药去ADCC和去免疫原性两大技术平台，正在开发去免疫原性阿达木、去免疫原性/去ADCC阿塔朱、去ADCC帕姆珠、去免疫原性英夫利昔等10余种创新抗体药，在Nature Medicine, Nature Genet. 、Immunity等著名期刊发表论文40余篇，申请发明专利20余项，并获得美国专利3项和中国发明专利6项。

三、会议费用

会务费：2800元/人，同一单位报名2人及以上，2200元/人（会务费包括：培训、答疑、资料、茶歇、培训期间中餐、培训证书等）； 住宿可统一安排，费用自理。

四、联系方式               

马超13240487419

附件二：  

       “2024蛋白表达、表征与结构解析专题培训班”报名表